Actualización Servidor R300 + Cabina MD1000

Buenos días,

Tenemos un PE R300 con Windows 2003 server (XXXXXXX) y una cabina PV MD1000 (XXXXXXX) que utilizamos como servidor de archivos.

Dichos archivos están todos en la cabina distribuidas en diferentes carpetas y con diferentes permisos dentro de nuestro dominio.

Queremos actualizar la versión del S.O. de 2003 server a una superior (2008 R2 o 2012).

Mi consulta es cuál sería la forma más correcta de hacerlo sin poner en peligro los datos almacenados en la cabina.

¿Podría instalar otro server diferente de igual modelo que dispongo (R300) instalar allí el nuevo SO y una vez dentro del dominio cambiar la tarjeta para unirlo a la cabina?

¿Puedo instalar el nuevo SO en el mismo server sin poner en peligro los datos de la cabina?

¿Alguna otra sugerencia?

Gracias de antemano. Saludos,